Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM7Q96FZ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM7Q96FZ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM7Q96FZ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms