Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPS1Q96D71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REPS1Q96D71 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms