Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1LQ96C74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROPN1LQ96C74 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms