Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFKQ969G6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFKQ969G6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms