Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C6Q969F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C6Q969F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C6Q969F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms