Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A3Q92570 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR4A3Q92570 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms