Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKIN2Q8WXE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms