Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BEST4Q8NFU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEST4Q8NFU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms