Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGI4Q8N135 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI4Q8N135 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms