Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC103Q8IW40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC103Q8IW40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms