Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC71Q8IV32 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC71Q8IV32 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms