Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP1Q7Z6B7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRGAP1Q7Z6B7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP1Q7Z6B7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP1Q7Z6B7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP1Q7Z6B7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP1Q7Z6B7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms