Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLRC3Q7RTR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRC3Q7RTR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRC3Q7RTR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms