Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC80Q76M96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms