Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIAA1549LQ6ZVL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIAA1549LQ6ZVL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms