Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM72Q6ZMU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM72Q6ZMU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms