Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00114Q6XXX2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00114Q6XXX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms