Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIG3Q6UXM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG3Q6UXM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms