Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPATA8Q6RVD6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPATA8Q6RVD6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms