Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM42Q69YG0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM42Q69YG0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM42Q69YG0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms