Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCERG1LQ5VWI1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCERG1LQ5VWI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCERG1LQ5VWI1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms