Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF20Q5VTR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF20Q5VTR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF20Q5VTR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RNF20Q5VTR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms