Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF220Q5VTB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF220Q5VTB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms