Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWA1

PPP1R15B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R15BQ5SWA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R15BQ5SWA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R15BQ5SWA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R15BQ5SWA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R15BQ5SWA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R15BQ5SWA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R15BQ5SWA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms