Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01559Q495D7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01559Q495D7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01559Q495D7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms