Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC153Q494R4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC153Q494R4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC153Q494R4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms