Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM12Q3MHD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM12Q3MHD2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM12Q3MHD2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM12Q3MHD2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms