Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSRP2Q16527 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP2Q16527 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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