Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VPS72Q15906 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
VPS72Q15906 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VPS72Q15906 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
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