Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIV2LQ15477 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIV2LQ15477 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIV2LQ15477 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms