Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP1Q15431 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP1Q15431 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP1Q15431 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
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