Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDK1Q15118 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK1Q15118 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK1Q15118 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK1Q15118 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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