Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1I3Q14994 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1I3Q14994 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1I3Q14994 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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