Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF3Q14653 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF3Q14653 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF3Q14653 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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