Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RBM39Q14498 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBM39Q14498 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBM39Q14498 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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