Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA3CQ13748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA3CQ13748 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA3CQ13748 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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