Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PWP1Q13610 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PWP1Q13610 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PWP1Q13610 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.9 ms