Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX3Q13185 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBX3Q13185 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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