Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLFQ13129 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLFQ13129 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RLFQ13129 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RLFQ13129 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RLFQ13129 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RLFQ13129 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLFQ13129 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RLFQ13129 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLFQ13129 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLFQ13129 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLFQ13129 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLFQ13129 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RLFQ13129 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RLFQ13129 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLFQ13129 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLFQ13129 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLFQ13129 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RLFQ13129 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RLFQ13129 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RLFQ13129 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLFQ13129 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RLFQ13129 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RLFQ13129 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLFQ13129 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RLFQ13129 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLFQ13129 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLFQ13129 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLFQ13129 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLFQ13129 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLFQ13129 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLFQ13129 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLFQ13129 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLFQ13129 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLFQ13129 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLFQ13129 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLFQ13129 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLFQ13129 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RLFQ13129 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLFQ13129 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLFQ13129 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLFQ13129 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RLFQ13129 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RLFQ13129 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLFQ13129 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLFQ13129 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLFQ13129 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLFQ13129 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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