Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 MHR1YDR296W 681 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 TRS31YDR472W 852 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 IRC22YEL001C 678 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 AAD6YFL056C 639 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 YBL036CYBL036C 774 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 DLT1YMR126C 1029 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 APA1YCL050C 966 nt8.47□□□□□ -1.05
YRR1Q12172 GPM2YDL021W 936 nt8.46□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 UPF3YGR072W 1164 nt8.46□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ECM1YAL059W 639 nt8.46□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YPR142CYPR142C 564 nt8.46□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 RFC1YOR217W 2586 nt8.46□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YEL028WYEL028W 462 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 HNT3YOR258W 654 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ELC1YPL046C 300 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YMC2YBR104W 990 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 PWR1PWR1 941 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 TMS1YDR105C 1422 nt8.45□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 GRH1YDR517W 1119 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YER137CYER137C 447 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 PIN2YOR104W 849 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YPL108WYPL108W 507 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ATP20YPR020W 348 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 SAD1YFR005C 1347 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YJR124CYJR124C 1347 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 CEG1YGL130W 1380 nt8.44□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 SPT3YDR392W 1014 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 TFG2YGR005C 1203 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 CBT1YKL208W 816 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 TOM7YNL070W 183 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 CPR8YNR028W 927 nt8.43□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 DMC1YER179W 1005 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ERV14YGL054C 417 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 MRS4YKR052C 915 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 CPR6YLR216C 1116 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 IMD1YAR073W 1212 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ENP1YBR247C 1452 nt8.42□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 DBP5YOR046C 1449 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 SRO9YCL037C 1305 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 QRI7YDL104C 1224 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YKR045CYKR045C 552 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 MTF1YMR228W 1026 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YPR071WYPR071W 636 nt8.41□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 ELP3YPL086C 1674 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 NSE4YDL105W 1209 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 TGL2YDR058C 981 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 RSR1YGR152C 819 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YIR035CYIR035C 765 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 AIM36YMR157C 768 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YMR166CYMR166C 1107 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 MET22YOL064C 1074 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YOR152CYOR152C 771 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 MED8YBR193C 672 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 YCL041CYCL041C 495 nt8.4□□□□□ -1.06
YRR1Q12172 SEC12YNR026C 1416 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 AAT1YKL106W 1356 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 ARD1YHR013C 717 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 SPO7YAL009W 780 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 AIM25YJR100C 984 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 RNA170RNA170 169 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YBR063CYBR063C 1215 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 FCY1YPR062W 477 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 RIT1YMR283C 1542 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 SLS1YLR139C 1932 nt8.39□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 CTF13YMR094W 1437 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 TPN1YGL186C 1740 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 MTO1YGL236C 2010 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YDL162CYDL162C 357 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 DSD1YGL196W 1287 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 STS1YIR011C 960 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 MND2YIR025W 1107 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 SPR3YGR059W 1539 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 HMG2YLR450W 3138 nt8.38□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 MAK11YKL021C 1407 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 FET5YFL041W 1869 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 AIR2YDL175C 1035 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 RNA15YGL044C 891 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 CHS7YHR142W 951 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 EFM3YJR129C 1020 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 TOM40YMR203W 1164 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 CAF40YNL288W 1122 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 GSP2YOR185C 663 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 NBA1YOL070C 1506 nt8.37□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YPK3YBR028C 1578 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YBR056WYBR056W 1506 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YDL124WYDL124W 939 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 CAK1YFL029C 1107 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YJL160CYJL160C 864 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YKL123WYKL123W 381 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 RCN1YKL159C 636 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YLR156WYLR156W 345 nt8.36□□□□□ -1.07
YRR1Q12172 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.9 ms