Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX9Q08211 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX9Q08211 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX9Q08211 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms