Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB3Q05901 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB3Q05901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms