Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBE1Q04446 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBE1Q04446 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBE1Q04446 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBE1Q04446 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms