Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 RPL7AYGL076C 735 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 ECM14YHR132C 1293 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YHC3YJL059W 1227 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YML018CYML018C 1182 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RPL7BYPL198W 735 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YPR196WYPR196W 1413 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 ACS1YAL054C 2142 nt4.93□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 MKK1YOR231W 1527 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YLL067CYLL067C 3618 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 HIR1YBL008W 2523 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RMD9YGL107C 1941 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RVB2YPL235W 1416 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 CDC34YDR054C 888 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RPE1YJL121C 717 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 VPS24YKL041W 675 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 AAT2YLR027C 1257 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 MRPL10YNL284C 969 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YOR300WYOR300W 309 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 GLN1YPR035W 1113 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 EFT2YDR385W 2529 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 EFT1YOR133W 2529 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 AFG1YEL052W 1530 nt4.92□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 VMA4YOR332W 702 nt4.91□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 IFA38YBR159W 1044 nt4.91□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 SLX5YDL013W 1860 nt4.9□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YEL068CYEL068C 333 nt4.9□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 RRS1YOR294W 612 nt4.9□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SGV1YPR161C 1974 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 ERG1YGR175C 1491 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 CLB2YPR119W 1476 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 RSA4YCR072C 1548 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 PYC1YGL062W 3537 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YET3YDL072C 612 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 BCY1YIL033C 1251 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP2tY(GUA)D 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP11tY(GUA)F1 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP6tY(GUA)F2 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP7tY(GUA)J1 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP4tY(GUA)J2 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP5tY(GUA)M1 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP8tY(GUA)M2 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 SUP3tY(GUA)O 75 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 TSA1YML028W 591 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YHM2YMR241W 945 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 HST3YOR025W 1344 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 NMT1YLR195C 1368 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 CRF1YDR223W 1404 nt4.89□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 KTR5YNL029C 1569 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 HVG1YER039C 750 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MRPS12YNR036C 462 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YPR114WYPR114W 948 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 PAT1YCR077C 2391 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MDM31YHR194W 1740 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MRC1YCL061C 3291 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 POX1YGL205W 2247 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 CLB1YGR108W 1416 nt4.88□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 LAG2YOL025W 1983 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 FRE5YOR384W 2085 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YDR387CYDR387C 1668 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 NAS6YGR232W 687 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 PSR2YLR019W 1194 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YNR040WYNR040W 771 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 TSR3YOR006C 942 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 RAD3YER171W 2337 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 KEX2YNL238W 2445 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 DSF1YEL070W 1509 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YNR073CYNR073C 1509 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 ATG22YCL038C 1587 nt4.87□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MAK31YCR020C-A 267 nt4.86□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 TAL1YLR354C 1008 nt4.86□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 IVY1YDR229W 1362 nt4.86□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 HAS1YMR290C 1518 nt4.86□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MPA43YNL249C 1629 nt4.86□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 RPL10YLR075W 666 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MRPS16YPL013C 366 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 GAT1YFL021W 1533 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 HXT15YDL245C 1704 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 HXT16YJR158W 1704 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 XBP1YIL101C 1944 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 MTC5YDR128W 3447 nt4.85□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 YKR023WYKR023W 1593 nt4.84□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 ALT2YDR111C 1524 nt4.84□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 TIM22YDL217C 624 nt4.84□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 FZF1YGL254W 900 nt4.84□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 LDS1YAL018C 978 nt4.84□□□□□ -1.63
YHP1Q04116 ATG4YNL223W 1485 nt4.83□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 RME1YGR044C 903 nt4.83□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 YBL070CYBL070C 321 nt4.83□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 NHA1YLR138W 2958 nt4.83□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 PHB1YGR132C 864 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 YHL018WYHL018W 363 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 YJU3YKL094W 942 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 YNL285WYNL285W 372 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 NHP6BYBR089C-A 300 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 PXL1YKR090W 2121 nt4.82□□□□□ -1.64
YHP1Q04116 MCM3YEL032W 2916 nt4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.7 ms