Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF90Q03938 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF90Q03938 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF90Q03938 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms