Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIBQ01892 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms