Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1BQ00975 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1BQ00975 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1BQ00975 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1BQ00975 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms