Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEP78395 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEP78395 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEP78395 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms