Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC5P78333 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC5P78333 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC5P78333 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC5P78333 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC5P78333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC5P78333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC5P78333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC5P78333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC5P78333 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC5P78333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC5P78333 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC5P78333 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC5P78333 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC5P78333 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC5P78333 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC5P78333 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC5P78333 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC5P78333 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC5P78333 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC5P78333 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC5P78333 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC5P78333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC5P78333 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC5P78333 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC5P78333 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC5P78333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC5P78333 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC5P78333 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC5P78333 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC5P78333 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC5P78333 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC5P78333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC5P78333 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC5P78333 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC5P78333 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC5P78333 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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