Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSNL1P62760 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSNL1P62760 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms